Библиотека nn_wien2k

Обзор

nn_wien2k — это библиотека Python для анализа атомной структуры материалов на основе данных из файлов WIEN2k case.outputnn. Библиотека позволяет парсить файлы, анализировать ближайших соседей атомов и представлять результаты в удобном формате.

Установка

Перед установкой nn_wien2k убедитесь, что на вашей системе установлен Python 3.6 или выше. Установить nn_wien2k можно с помощью pip:

pip install nn_wien2k

Использование

Основные функции

1. parse_file(filename: str, distance: float = 3.0): Парсит файл case.outputnn и возвращает структурированные данные о ближайших соседях атомов.

2. print_results(results: defaultdict): Выводит результаты анализа в консоль в читаемом формате.

Применение

from nn_wien2k import parse_file, print_results

Путь к вашему файлу case.outputnn

file_path = "path/to/your/case.outputnn"

Парсинг файла

results = parse_file(file_path)

Парсинг файла с другим параметром отсечки ближайших соседей (в ангстремах)

results = parse_file(file_path, distance=4)

Вывод результатов в консоль

print_results(results)

Как читать результаты

%Атом 1% (количество: %количество атомов с таким окружением%):
  %Сосед атома 1%:
    %Расстояние до этого соседа в ангстремах% ANG: %количество таких соседей%
  %Сосед атома 2%:
    %Расстояние до этого соседа в ангстремах% ANG: %количество таких соседей%

%Атом 2% (количество: %количество атомов с таким окружением%):
  %Сосед атома 1%:
    %Расстояние до этого соседа в ангстремах% ANG: %количество таких соседей%
  %Сосед атома 2%:
    %Расстояние до этого соседа в ангстремах% ANG: %количество таких соседей%

Пример результатов для кобальта

Co (количество: 1):
  Co:
    2.50627 ANG: 12

Пример результатов для Co2Si

Co (количество: 72):
  Co:
    2.50117 ANG: 2
    2.53369 ANG: 1
    2.58921 ANG: 2
    2.64556 ANG: 2
    2.67629 ANG: 1
  Si:
    2.33247 ANG: 2
    2.47252 ANG: 1
    2.56521 ANG: 2

Co (количество: 72):
  Co:
    2.53369 ANG: 1
    2.58921 ANG: 2
    2.64556 ANG: 2
    2.67629 ANG: 1
    2.67865 ANG: 2
  Si:
    2.31330 ANG: 2
    2.32709 ANG: 1
    2.34772 ANG: 1
    2.62046 ANG: 1

Si (количество: 72):
  Co:
    2.31330 ANG: 2
    2.32709 ANG: 1
    2.33247 ANG: 2
    2.34772 ANG: 1
    2.47252 ANG: 1
    2.56521 ANG: 2
    2.62046 ANG: 1
  Si:
    3.14728 ANG: 2